一、集成到程序中
由于用户一般不会主动运行木马程序，而种木马者为了吸引用户运行，他们会将木马文件和其它应用程序进行捆绑，用户看到的只是正常的程序。但是你一旦运行之后，不仅该正常的程序运行，而且捆绑在一起的木马程序也会在后台偷偷运行。
这种隐藏在其它应用程序之中的木马危害比较大，而且不容易发现。如果捆绑到系统文件中，那么则会随Windows启动而运行。不过只要我们安装个人防火墙或者启用Windows XP SP2中的Windows防火墙，那么在木马服务端试图连接种木马的客户端时，则会询问是否放行，据此即可判断出自己有无中木马。
二、隐藏在媒体文件中
这种类型严格上说，用户还没有中木马。不过它的危害容易被人忽略。通过八哥网的调查发现，大家对影音文件的警惕性不高。它的常用手段是在媒体文件中插入一段代码，代码中包含了一个网址，当播放到指定时间时即会自动访问该网址，而该网址所指页面的内容却是一些网页木马或其它危害。
因此，当我们在播放网上下载的影片时，如果发现突然打开了窗口，那么切不可好奇而应将其立即关闭，然后跳过该时间段影片的播放。
三、隐藏在System.ini
System.ini中也是我们找出木马藏身之地的一个绝佳地方。运行“msconfig”打开系统配置实用程序，切换到“SYSTEM.INI”标签，也可以直接打开Windows安装目录下的System.ini文件，然后查看[boot]区域中“shell=”这一行，如果显示“shell=Explorer.exe”，则表示正常。如果是其它内容，那么则说明可能中木马了。其次在[386Enh]区域，同样要检查“driver=路径＼程序名”，如果发现有来历不明的文件名那么也可能是木马。
四、隐藏在Win.ini
与System.ini相似，Win.ini中也是木马喜欢加载的一个地方。对此我们可以打开系统目录下的Win.ini文件，然后查看[Windows]区域“load=”和“run=”，正常情况下它们后面应该是空白，如果你发现它们后面加了某个程序，那么加载的程序则可能是木马，需要将它们删除。
五、隐藏在Autoexec.bat
在C盘根目录下有一个Autoexec.bat文件，这里的内容将会在系统启动时自动运行。与该文件类似的还有Config.sys。因为它自动运行，因此也成为木马的一个藏身之地。对此我们同样需要打开这两个文件，检查里面是否加载了来历不明的程序在运行。
木马之所以能够为非作歹，正是因为其善于隐藏自己。建议在安装杀毒软件的同时也安装雨过天晴一键还原，使用方便。不过我们掌握了其藏身之处，那么则可以将其一一清除。当然，木马在实际的伪装隐藏自己中，可能会综合使用上面一种或几种方法来伪装，这就需要我们在检查清除时，不能只检查其中的部分地点
